La CPDH tiene dos instancias organizativas la Junta Directiva que es su máximo órgano de toma de decisiones y la Secretaría Ejecutiva, cuya función es dirigir, controlar y supervisar el trabajo de la CPDH y “ejecutar” las decisiones de la Junta Directiva bajo la guía de la Misión y Visión de la CPDH.

La Junta Directiva está integrada por personas notables de la sociedad nicaragüense, de reconocida solvencia moral y transparencia, sin propósitos partidarios, imparciales, que realizan una labor humanitaria y voluntaria en pro de los derechos humanos en Nicaragua. Está integrada por:

• Dr. Nicolás Bolaños Geyer

• Lic. Carlos Huembes Trejos

• Sra. Argentina Novoa de Rivas

• Lic. Raymond Genie Peñalba

• Sra. Digna Zamora de Corea

• María Auxiliadora de Herdocia

• Luis Amado Peña

• Lic. Consuelo Sequeira

La secretaría Ejecutiva es asumida por el Lic. Marcos Carmona Rivera.

La Secretaría Ejecutiva, para el cumplimiento de su función está organizada en tres direcciones, que trabajan coordinadamente como un solo equipo:

• Asesoría Jurídica, cuya función principal es el desarrollo de actividades propias de la Defensa de los Derechos Humanos de las personas u organizaciones que solicitan el apoyo de CPDH o ante aquellas situaciones que consideramos necesaria nuestra intervención. De igual forma, se encarga del análisis, investigación y formulación de propuestas para la incidencia jurídica.

Lo anterior, implica el proceso de asesoría, información y acompañamiento a las personas que interponen denuncias ante CPDH, de igual forma, esta dirección se encarga de orientar los procesos de formación jurídica tanto de los /as coordinadores /as de filiales como de los pasantes de derecho que apoyan a las diferentes filiales y a la sede central.

• Proyectos y Capacitación, se encarga del proceso de formulación, monitoreo, seguimiento y evaluación de proyectos. También está a su cargo el desarrollo del proceso de planificación institucional. Esta dirección coordina las acciones de formación de los /as promotores y promotoras, asi como del personal de CPDH, para garantizar el desarrollo de las acciones de promoción tanto en el ámbito local como nacional.

• Administrativa – Financiera, funciona sobre la base del seguimiento, formulación presupuestaria, así como la implementación de las medidas de control interno y de contabilidad, en correspondencia con las Normas de Contabilidad Internacionalmente Aceptadas.